rozprawki1626

Genetic variants regulate expression of SMIM1 and the Vel blood group antigen. Extensive genotyping of blood groups Duffy Kidd and AB0 by next generation sequencing. Obok często stosowanych protokołów typu home-made, opartych na idealnych metodach biologii molekularnej, i zaawansowanych metodzie i egzaminów ze znakiem informacje dla wyrobów medycznych do diagnostyki in-vitro (IVD, in vitro diagnostic device directive) do typowania antygenów grup krwi, jest szybka implementacja najnowszej technologii sekwencjonowania następnej generacji (NGS, next generation sequencing) do poszukiwań polimorfizmów, które tworzą podłoże swoistości antygenowych. 1. Avent N.D., Madgett TE., Halawani A.J., Altayar M.A., Kiernan M., Reynolds TJ. Next generation sequencing: academic overkill or high-resolution blood group genotyping? 2. Altayar M.A., Halawani A.J., Kiernan M. i wsp. 10. van der Schoot C.E., Ait Soussan A., Beckers E. i wsp. 12. https://abcszkolne.pl/material/982/kartkowka-mapa-fizyczna-europy , Costa D., Fiorito C. De lorio G., Grimaldi V, Napoli C. Erytrocyte genotyping with HEA Bead Chip Kit: our experience at Azienda Ospedaliera Universitaria, Second university of Naples. W zestawieniu badacze podkreślili, że rozbieżności wyników genotypowania allelu JK otrzymane techniką HEA BeadChip i fenotypowania antygenów Jka i Jkb są bardzo eleganckie (7/60 000), co wpływa wysokiej wiarygodności stosowania metod molekularnych w determinacji antygenów z tego układu.

Badacze wykryli siedem różnic między genotypem i liczonym fenotypem a oznaczeniami serologicznymi - dwa pod względem określenia obecności antygenu Jka i pięć dotyczących antygenu Jkb. 02.988A.1095C o obniżonej ekspresji antygenu Jkb. A weak kodującego warianty antygenu Jk(a) o osłabionej ekspresji. W sesji plakatowej także zaprezentowano szereg doniesień o znalezieniu nowych alleli kodujących warianty okazujące się osłabionym fenotypem lub nieulegające ekspresji, które wykryto metodami analizy DNA. Metodami serologicznymi takie modele są określane jako Jk(a-). Wyniki oznaczenia antygenów RhC, E i Kell obiema metodami wykazały jeden wynik inny w sile dawców i aż 27/50 w klasie pacjentów. Podsumowując, można usłyszeć jak wysokie zainteresowanie metodami genotypowania antygenów krwinki czerwonej i wzrastająca dostępność platform i technologii do poszukiwań o dużej przepustowości przenosi się na rozwój wiedzy na problem bogactwa podłoża molekularnego różnych swoistości antygenowych. Na XXXIII światowym zjeździe w Seulu, w Korei Południowej, zastosowanie metod analizy kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA, deoxyribonucleic acid) w poszukiwaniach antygenów krwinek mórz i płytkowych prezentowano na sesjach „Genotypowanie Grup Krwi” (Blood Group Genotyping), „Białka Błonowe Krwinki Czerwonej” (Red Cell Membrane Proteins), „Genotypowanie grup krwi: nowy zwolennik w laboratorium” (Blood genotyping: a new ally in your lab) także na konferencji satelitarnej zorganizowanej przez firmę Grifols.

Obecnie analiza DNA do badań antygenów krwinek koncentruje się przede każdym na typowaniu wielokrotnych dawców krwi w celu wynajdywania postaci z nielicznymi antygenami lub genotypami będącymi z prostą częstością, lecz więcej w coraz szerszym stopniu badania zatrzymują się popularne w nawiązaniu do pacjentów wymagających wielokrotnych transfuzji. Dodatkowo wykonane badania całych sekwencji genów przekazują wiedz o byciu wzorów mutacji polimorficznych w przyszłych krajach alleli kodujących antygeny grup krwi, a znaczenie wykrywanych sprzężeń w nawiązaniu do zjawisk immunologicznych staje się kolejnym wyzwaniem dla badaczy. Zaznaczył, że przy wyborze metody i charakteru genotypowania należy zapisywać się własnymi sprawami i uwarunkowaniami oraz opracować plan genotypowania dawców w odniesieniu do oferty ekonomicznych danego ośrodka, szczególnie przy poszukiwaniu cech rzadkich, gdy badania dotyczą dużych liczebnie grup. Jeżeli teraz istniejesz w zakręcie, w pochyleniu, zapomnij o zwalnianiu czy - o zgrozo! Różnica pomiędzy tymi wiedzami przejawia się wtedy, gdy pytamy o powody akceptacji bądź odrzucenia danej koncepcji.

Badacze podkreślili dużą siłę występowania różnicy między technikami genotypowania a fenotypowania i potrzebę opracowania algorytmu włączenia badań genotypu antygenu Fya/Fyb jako koniecznego uzupełnienia oznaczeń serologicznych. Na wykonanie prelegent podkreślił, że z jednej strony obecnie stosowane są w wszyscy skomputeryzowane platformy do genotypowania grup krwi o dużej przepustowości, z pozostałej natomiast uzupełnianie baz danych wciąż robi się ręcznie przez operatora, gdyż brakuje rozwiązań pozwalających przepływ relacji między wykorzystywanymi platformami oraz systemami szpitalnymi czy laboratoryjnymi. Po przesłaniu odpowiedzi zostaną wystawione oceny (bądź nie, bo nie wszyscy odzywają się do mnie). Novel alleles at the Kell blood group locus that lead to Kell variant phenotype. Duffy blood group typing: is genotyping more accurate than phenotype for Duffy Blood grouping? Pełne zsekwencjonowanie alleli kodujących antygeny z układu Duffy wykazało obecność dwóch kolejnych miejsc polimorficznych w eksonie drugim (obok kodujących antygen Fya i Fyb) i czterech rozprawka . Badacze opracowali drugie etapy sekwencjonowania antygenów z zespołów Rh, Duffy i Kidd: przygotowanie biblioteki przez amplifikację całkowitej sekwencji genomowej alleli kodujących swoistości antygenowe z wykorzystaniem reakcji łańcuchowej polimerazy o wielkim zasięgu (long-range PCR, long-rangepolymerase chain reaction), ich fragmentację i ligację z oligonukleotydami adaptorowymi, zawierającymi sekwencje kodu z identyfikatorem, aż po sekwencjonowanie mieszaniny 70 próbek na raz.